《中医辞海》共收集中医学及有关辞条5万余条，其中包括互见条。鉴于中医学概念、名词、术语规范化尚在研究进行中，本书依据中医理论体系中习用的概念、名词、术语做为正名。
本书收录辞条均注明定性词。由于中医学体系的独特性及各学科间分化的渗透性，许多辞目兼见于基础理论和临床各科，对于这些不易分类者，均使用“中医术 语”定性或按较为通用的分类方法定性，再逐一详述；另外对于一些古今沿用的、与中医学关系密切的术语如节气、天干等，一律未加定性词。本辞书中“基础理论 名词”，专指《中医学基础》所涵盖内容；病名、病证名、病症名按中医学规范意义使用，对其中内涵有重迭者，按传统习惯用法使用，特此说明。此外，综合性医 书、医学全书、医学丛书按“图书联目”用法分类；而一些不易严格分类者，统称“医书”。
本书按照《辞海》检字表的顺序排列辞条。辞条名的第一字在《辞海》检字表中的位置，决定该辞条在本书中的排列顺序；第一字相同的辞条，按第二字的笔画、笔顺排列；以下类推。